公元七世纪吐蕃王朝初期，佛教传入藏族地区，传说九世纪中叶吐蕃王朗达玛灭佛时，西藏"三贤哲"携先师角若理尖参译著的佛典藏经等逃到西藏阿里三部地区，在那里尚末站稳脚根，后又经回纥，吐谷浑来到多麦（青海）地区.肴格迥，藏饶色和玛，释迦牟尼三位贤哲广为布道，弘扬佛法，拉开了西藏佛教"后弘期"的序幕。

肴格迥等贤哲身前留下遗训，可在此地（今大佛寺）建寺筑堂。三贤哲圆寂后，汉藏，蒙各族教民遵其遗训，念其功德，在此建寺造堂。该寺始建于公元990年，距今己有千余年历史，它不仅在藏传教佛发展史上具有特殊的地位，而且在整个藏族地区以及国内外信教群众享中有较高的声誉，明洪武二十七年（1934年），西宁卫曾秦请朝廷，敕赐额日"宁蕃"。

公元1922年，第七世夏茸尕布根敦丹增诺布曾整修大佛寺，整修后的大佛寺占地30余亩，由前院，后院，马房和花园等组成。前院建有山门，经堂，僧舍；后院有一大殿，是一组两进两侧院的建筑群，后院大殿为三层空心阁楼，内有三像，中为肴格迥，两边为藏饶色和玛，释迦牟尼，佛像后壁是一组大型浮雕泥塑，画面有山水人物，十八罗汉，佛本生故事等，大殿重檐歇心屋顶，飞檐起翅，青色简瓦面，正脊装有宝瓶，两端设有兽吻，下部为藏式大墙面碉房式建筑，上下汉藏建筑艺术融为一体，殿前一对石狮，院内杨柳，沙枣，樱桃等绿树成荫，花园内丁香，芍药争相开放，香气袭人，1958年，殿内佛像被毁，1967年文革期间，遇到拆殿堂的破坏。

十一届三中全会以后，在党的民族宗教政策感召下，修复大佛寺被一些宗教界人士提到台前案面。

八十年代，第八世夏茸尕布洛桑隆柔丹巴嘉措主持拟定复修规划，动工之初不幸圆寂（即1991年5月30日）。1991年5月27日，第八世夏茸布之经师雍增，洛桑克珠嘉措受托，主持重建大佛寺，至此，雍增大师几经筹划于1992年底开始破土夏建。在政府的大力支持下，经过广大信教群众及社会各界的共同努力，已圆满竣工，并于2000年9月22日（农历）举行开光典礼。