唐代，纳西族社会生产得到发展，创造了象形文字，受到南诏与吐蕃的文化医药的影响，形成了纳西族巫教－东巴教。尔后出现了大量的东巴经典，记述了从原始社会到封建社会的医药文化知识。如《崇仁播迪找药》记载了药物，《点龙王药经》记载了乳为补益用，《神将药品经》记载了洒药。又如《布扎》（祭中风瘫痪鬼经）《几扎普米》（驱瘟疫鬼经）《送毒鬼经》等，则完全是对病魔、恶神、自然灾害的咒语。
　 纳西族先民很早就以草药防病治病并延续至今，民间医多为巫医，应用自己实用之医术治病的同时，也应用其他民族的医药手段治病。
　 巫医：原始宗教的巫与医紧密地结合一起，巫医跳神治病，首先是占卜、打卦，通过卦的显示，决定治疗方式。一般驱鬼念经，卦不显示，跳神给药或施术，巫医一般掌握20种药品，以及行施扎针、拔火罐、草药熏鼻、火草点穴，草药外用等方法。
　 清代道光二十年，丽江鸣音乡冷水沟，大东巴阿普肯命，有一册东巴医药专书《称恩说律》，书中记载有草药、动物药、矿物药200余种，他据此行医，医术精深，当地人民甚为赞誉，此书在东巴之间相互传抄，为行医延寿之道。
　 纳西族医药形成多元性发展，明朝以来藏族医药学术发展迅速，北移的纳西族与藏族混居一起，吸收藏医知识。清代随着中医药的进入，纳西族医药增添了中医知识。民国时期外国传教士带进西方医药，开设医院。传授西医药知识。民国时期，和纯厚搜集玉龙本草标本328种。压制整理成册，阐述了纳西族用药，是民族药与中药的结合。

西族分布在云南丽江、永宁和四川、西藏的部分地区。丽江素有"药材之乡"的誉称。丽江境内有药材2010种。按水平分布，以玉龙山为界，可分为东西两片。西片特产猪苓、竹红蕈、滇豆根、黄射干、三尖杉、五倍子、榧子等。东片特产天冬、穿山甲、菟丝子、五灵脂、麻黄、佛手、龙骨、黄药子、金丝马尾黄连。
　 按垂直分布，玉龙山为标志，海拔2000米以下的金沙江畔，亚热带代表药材天花粉、川楝子、蜈蚣、斑蝥虫、楣子、桔梗、茯苓、三七、丹皮，白胶香、山慈菇、龙衣、谷精草，蜜蒙花、滑石。海拔2000～3000米为高山温凉地带，代表药材当归、人参、西洋参、木香、秦艽、鹿仙草、珠子参、紫丹参、叶三七、麝香、熊胆、猴骨。海拔4000米为高山寒湿地带，代表药材虫草、贝母、岩菖蒲、雪茶、雪莲花、缘绒蒿等。
　 在纳西族民间，有自挖、自制、自用药物的传统历史。清代道光年间，纳西族名医和介山、习谭对丽江药材精心研究，发掘了本地药材加工施用，其他药号亦自采、自制。
　 "寿元堂"自制虎潜丸，主治风湿病；健脑参茸丸，补益气血；坤顺养心丸，补心安神；滋阴明目丸，补肾明目；雪水紫金锭，主治小儿惊风症，及小儿高热抽搐。
　 "长春堂"自制大五香丸，主治虚劳症；小五香丸，清热解毒，主治小儿惊风等症；巴豆丸，泻火主治下泻；炼制三仙丹，主治梅毒疮疡；熬制治风湿，跌打，劳伤膏药。
　 清代光绪二十年（1894），光绪丽江府志稿卷三物产部份载"当归俱以丽产号发他省"。说明丽江种植当归药材已一百多年历史。1933年从印度引进木香种子在鲁甸乡种植成功，成为药材商品。1959年从东北引进入参苗在鲁甸栽培成功，尔后引进省外药材种子18种，还有野生变家种的如秦艽等15种，其他32种为本地家种药材。

纳西医诊病方法

看头发：拔出一根患者的头发，观其根部，带有一团乳白色物，此人气血旺盛；
　 看眼睛：眼球发黄是胆病，发红是肚里有火，发生白点是体虚，大人平日流泪是风眼；
　 看鼻子：小孩手指常揉鼻子是疳积，鼻腔内生白疹子是肺热，大人鼻尖呈灰黑色是肾病，且重；
　 看耳朵：平人耳轮红润，耳轮呈灰黑色是肾病，现于上端病轻，整个耳轮呈灰黑色而枯是重病；
　 看口唇：唇淡黄或发白是体虚或有内病，唇紫是胃里有水，久病老人，口唇发白，眼眶发黑，眼球深陷是无治之症。
　 看牙齿：常人牙齿，牙龈丰满红润。如牙齿干瘪而发白是血虚，久病之人突然牙齿发黑，病势危急。
　 看舌头：舌苔黄厚、干燥有槽是体内实火严重，舌苔灰黑是肾病，舌苔发白是胃寒；
　 看脸色：男子脸色呈灰白是饮食不消，女子脸色呈灰白是妇科病，气候变化脸盘时肿时消是风湿病，脸色寡白为肺病，脸色乌黑枯象是肝肾重病，早晨脸色青灰，中午呈红色，傍晚为青紫，视为麻疯病；
　 看指甲：甲壳色淡是血虚，甲壳凸凹不平有白点、裂纹、节状是气虚；
　　颈项强直，腰不得弯，四肢抽搐，咬牙是惊风病，面浮是风肿，腹胀是气肿，足浮是水肿；
　 问鼻涕：鼻涕清稀为伤风病，黄脓为风寒内闭，咳嗽痰多黄脓带血为肺部疾病；
　 问汗液：恶寒发热出汗为伤风之汗，夜间盗汗是血虚之汗，白天自汗是气虚之汗，黄汗沾衣为黄疸之汗，出油汗病势垂危或急性病；
　 问大小便：小孩大便泡沫多是肚里有风，大便粘液红白是痢疾，恶臭者是火气重；
　 看小便：取患者第一次尿中段的大半碗，用麻杆一根长约三尺，先用麻杆在尿中划一米字形，然后搅拌，视其沉淀物、颜色、泡沫形状等。尿中有沉淀物呈粉红色是患感冒病；再经搅拌后尿呈灰色且有浊状是病情加重；尿呈清水状，泡沫浮起多是患者喝过澡水；如蛇和乌鸦洗过澡的山里塘水，症状为失眠、腹痛、腹胀、眼皮浮肿；尿呈黄色体内有热；尿呈白色膀胱病；尿呈绿色则风湿病；再麻杆搅拌尿碗时，立即出现泡沫加进麻杆碎片数节，麻杆点沾碎片，如有三节连接沾有麻杆顶端则为蛊症；妇人小便经麻杆搅拌泡沫浮起多、立即破裂为怀孕二月。
　 闻声音：久病老人卧床不起，注意语声、咳声、痰声、喘声，如有病情变化，声音与往日不同，传声不远，即将去世。
　 切脉：人体分为三段，第一段头至颈，第二段肩至脐，第三段脐至足，手腕脉亦分三段，靠手掌方向为第一段脉，主管人体第一段疾病。中间为第二段脉，主管人体第二段疾病。后方第三段脉，主管人体第三段疾病。医生按脉用食指、中指、无名指切三段脉，正常人食指脉反复搭一搭一搭连续跳动，如跳了一下，第二下无感觉或间隔时间稍长又跳一下，此脉头上有病，中指脉跳了一下，第二次跳动间隔时间不均匀，此脉心肺之病。如间隔时间短而促则为心病和急性病。无名指脉跳动太慢或跳动不均匀，说明脐下某个部位有病。
　 小儿生病看食指：伸开手掌，观其阳面，血管颜色定病情，食指第一关节至第二关节间血管呈青绿色为惊风症，第一节至指尖呈紫黑色则为病情凶恶，难以治疗。